• 螢光顯微手術 •
• 臨床免疫重症複雜創新治療 •
(一)白斑症 (Dyschromia) 免疫療法，療效顯著
白斑症起因於皮膚色素遭受自體免疫細胞破壞而產生皮膚白色斑塊，病變多為進行性，影響病人甚巨，自日據時代至今百年來一直無法有效控制治療，本院過敏免疫風濕科自2006年起針對白斑病理機轉，開始使用免疫藥物。
治療效果
96.2 %的病人在三個月內就能控制住病情，能有效停止白斑擴散，持續治療下，3-4年內，80.5 %的病人能有不同程度的色素回長，甚至回復正常膚色。每年就診人數已達2656人，持續累積人次已達1萬2千多位病人次，求診病人遍及台灣及海外。
治療經驗分享
1. 研究成果於風濕病醫學期刊論文發表
(Formosan Journal of Rheumatology. 23(1):14-19, 2009.)
2. 區域醫療研討會深入討論交換治療經驗
3. 接受其他醫院學習觀摩，已有多家醫療單位開始臨床治療。
(二)貝歇氏症腸道發炎重症 (Inflammatory Bowel Disease in Behcet disease) 創新治療
貝歇氏症為免疫重大傷病，臨床症狀為虹彩炎、泌尿道潰瘍及口腔潰瘍。在東亞的病人特別有較嚴重的腸胃道病變，與潰瘍性大腸炎和克隆氏症並列為三大腸胃道發炎疾病。自本院2000年開院以來，已有24位貝歇氏症合併嚴重腸胃道發炎病人，由台灣各地至本院治療：其中17位是以腸胃道阻塞 ( pseudotumor obstruction ) 表現 (70.84%)，7位是大腸穿孔 ( colon perforation ) (29.16%)。
本院為亞洲率先使用單株抗體adalimumab 50mg Q2W治療貝歇氏症腸道發炎重症的醫院，平均使用三個月後可緩解疾病進展，95.83%病人的腸壁增厚治療後可以緩解；20位病人 20/24 ( 83.3% ) 無腸道再出血 (rebleeding)；7位腸穿孔病人中，6位無腸道再穿孔 (reperforation) 6/7 (85.7%)的情形。
治療經驗分享
1. 2004年亞太風濕醫學會 (APLAR) 於韓國濟州島，台、日、韓專家圓桌會議發表治療經驗獲得肯定。
2. 2013年中華民國風濕病醫學年會經驗分享。
3. 2017年2月主持專家共識會議，建議台灣貝歇氏症重度腸道穿孔治療指引方針。
• 關節鏡軟骨再生促進術 •
關節中心於2005年提出了一項全新的手術策略:「關節鏡軟骨再生促進手術」 （Arthroscopic Cartilage Regeneration Facilitating Procedure, ACRFP），本手術是以關節鏡為主要工具來治療退化性膝關節炎的整合型手術方式，結合「關節鏡內側放鬆術」（AMR）、「滑膜切除術」（Synovectomy）、「軟骨形成術」（Chondroplasty）、「部分半月板切除術」（Partial Meniscectomy）、以及「經皮外側放鬆術」（Percutaneous Lateral Release, PLR）等幾種治療術式，針對不同嚴重程度給予相對應之組合式療法。
關節鏡軟骨再生促進手術」的治療理論基礎經過基礎醫學研究及臨床實際驗證，主要治療標的包括：
(1) 移除任何膝關節內的異常摩擦（如軟骨碎片）或夾擊現象（如發炎腫脹變厚的滑膜囊）。
(2) 調節並釋放各關節面之間，因軟骨組織長期反覆發炎所引起的過度張力，以解除關節面軟骨承受的不當壓力。
(3) 清除膝關節內所有會引起軟骨崩解的肥厚發炎滑膜囊。
經由本手術，術後病人滿意度達94.1%以上，其Knee Injuary and Osteoarthritis Outcome Score（KOOS）及Knee Society Score（KOS）均有明顯的進步，Joint space也有增加的情形，研究成果發表在BMC Musculoskeletal Disorders, Medicine等期刊上，共12篇。近年來已為國際專家接受，並獲邀參與教科書相關章節之編寫。
2014年在證嚴上人的支持下，在台北慈濟醫院成立了第二間膝關節健康促進中心。
2014年亦指導台中慈濟醫院骨科醫師來院學習，同年6月台中慈濟醫院「膝關節健康促進中心」啟用。
國內醫療院所，共有三家醫院「台北市立和平醫院、台中澄清醫院-平等院區、屏東基督教醫院、新北市雙和醫院」等院，共七位醫師，已完成膝關節健康促進研習課程；完成認證醫師一人。
國外部份有三個國家「阿布達比、印度、孟加拉」共5位醫師，已完成膝關節健康促進研習課程。
2016年關節中心參與並獲選完成醫策會「醫院參與研發醫管服務整合產品〈解決方案〉委外案-膝關節健康促進方案-退化性膝關節炎之整合型預防及治療方案」之醫療技術轉移推廣計畫案，已具備正式開始接受各醫療院所之技術轉移訓練申請。.
因「膝關節健康促進方案」獨特的治療方式，吸引國外病患遠渡重洋，跨海求治，國際醫療病患日益增多，已接受手術之病患，自2014年6位、2015年8位、2016年23位、2017年29位、2018年34位、2019年1~5月14位，預約門診及手術國際醫療病患，持續增加。
• 器官移植 ：肝臟、腎臟 •
1. 本院於民國2001年成立器官捐贈暨移植小組，為雲嘉地區最早執行多重器官（肝、腎）移植手術的醫院，更是僅次於高雄長庚最早執行活體肝臟移植手術的醫院。於2013年改制為移植醫療中心，整合醫療資源提昇病人安全。
2. 至今完成113例肝腎移植及捐贈手術，其中63例為移植（含活體）手術，另外他院移植後於本院追蹤治療的病人為24位，大多為雲嘉地區患者，達到便民服務。
3. 依據健保署2016年最新公告移植存活率，本院腎臟移植3年存活率達到94%，全國排名並列第五(8/37)，肝臟移植五年存活率為70%（相當全國平均），術後五年活體腎臟移植存活率為100%、肝臟為80%，成果優良。
• 尖端放射治療整合照護模式 •
卓越醫療品質: 本科以病人為中心提供安全舒適的醫療環境，並且癌症治療團隊的經驗豐富，更全面及完整的照護品質支持病人完成療程。放腫顆多次參與全國醫療品質及病人安全競賽獲各方專家學者肯定獲獎無數。
♦l 2015年第16屆醫策會醫療品質競賽_銀獎、第28屆全國團結圈競賽_金塔獎
♦l 2018年第19屆醫策會主題類競賽菁英組_銅獎
五大職類團隊合作組成共事，。癌症病人在治療過程是需要多團隊科室共同合作參與照護，期許未來能整合更多癌症治療相關科室，共同檢視流程的安全性，讓癌症照護更全面、病人安全能更提升。
2010年成立光子刀及銳速刀中心執行高精準度放射手術（誤差值< 0.75 mm），讓病人可有免於開刀的治療選擇。更優化放射治療計畫，以進行全腦脊髓照射及雙側乳癌體積調控弧形治療，治療結果明顯減少正常器官劑量。
於2016年引進標靶真光刀（True Beam），為南部第一家醫院，搭配6D智慧調控床，並創新呼吸調控治療技術（深吸氣閉氣放射治療模式和視覺回饋治療模式），以進行全身立體定位放射手術。更合併腫瘤內部增量及體積調控弧形治療技術(SIEB-based VMAT)，精準執行放射治療，提高病人腫瘤控制率及存活率，同時降低嚴重副作用發生率，系統性確保病人治療安全。於2016年榮獲醫策會「卓越中心」肯定。
開發整合型放射腫瘤資訊平台（Integrated Radiotherapy Oncology Information Platform [IROIP]），將放射治療全流程電子化管控，系統性提升放射治療安全，提升整體醫療品質，其中「醫療異常值警示系統」及「醫療平台及其整合查詢系統」更獲得2項國家專利。於2015年榮獲醫策會銀獎暨創新獎，經濟部工業局全國團結圈金塔獎，並於2016年9月與上市公司承業生醫企業集團簽訂技術轉移合約。
• 換水大腸鏡技術 •
1. 率先將換水大腸鏡技術引進台灣，成立全國性訓練中心。本院在此項技術上為國內先驅，先行推廣至台中榮總及花蓮慈濟醫學中心，並持續有學術上之研究發表，治療成果已發表6篇SCI 論文刊登在包括American Journal of Gastroenterology等知名期刊上。
2. 於2015年首度舉辦換水法大腸鏡檢查訓練課程，2015年至2016年期間，共有8家醫院、29位醫師參與研習。
3. 本技術由基礎到臨床的研究成果。
(1)經動物實驗結果證實水下息肉切除，顯著可減少腸壁的熱傷害。
(2)最大插入疼痛指數：換水大腸鏡顯著低於傳統灌氣大腸鏡，可以減少一半以上的疼痛。
(3)不同腺瘤檢出率ADR：研究顯示換水大腸鏡較傳統灌氣大腸鏡有較高的檢出率，約高出8.5%。本技術為傳統大腸鏡的重大突破，具有較少的副作用，且有較好的腫瘤發現率。
4.榮獲2017國家品質標章（SNQ）認證
• 臨床核子醫學影像單位 •
全國第一家通過以ISO15189 醫學實驗室規範實地認證
1. 大林慈濟醫院率先取得核醫實驗室認證-創下亞洲首例紀錄，從日常工作落實國際標準的技術規範及品質管理
2. 國際核子醫學影像專業間，首家獲得國際認證組織TAF，以ISO15189認證之核子醫學影像中心~大林慈濟醫院核子醫學科https://www.youtube.com/watch?v=JUALFNRGhQs
3. 於2014年榮獲國家品質標章的肯定，是全國第一家以醫學影像檢查得獎的單位。
