● 分子醫學中心     ● 失智症中心     ● 高齡緩和醫療中心    ● 高功能運動醫學中心     ● 疼痛治療整合中心
● 移植中心     ● 國際醫療中心     ● 健康管理中心      ● 過敏免疫風濕中心      ● 減重暨代謝手術治療中心
● 智慧醫療創新中心     ● 腫瘤中心     ● 預防醫學中心     ● 睡眠中心     ● 臨床心理中心     

● 一般內科     ● 小兒科     ● 心臟內科     ● 血液腫瘤科     ● 老年醫學科     ● 身心醫學科
● 放射腫瘤科     ● 神經內科     ● 家庭醫學部     ● 胸腔內科     ● 腎臟內科     ● 過敏免疫風濕中心
● 復健科     ● 腸胃內科     ● 新陳代謝科     ● 感染科     ● 職業醫學科              

● 一般外科     ● 大腸直腸外科      ● 口腔醫學部     ● 心臟血管外科     ● 皮膚科     ● 耳鼻喉頭頸外科     
● 泌尿科     ● 神經外科     ● 胸腔外科     ● 骨科部     ● 麻醉科     ● 移植外科     ● 眼科     ● 婦產部
● 整形外科     ● 關節中心            

● 急診部     ● 中醫部

● 大林慈院住宿長照機構     ● 大林慈濟產後護理之家     ● 長照管理中心      

● 核子醫學科     ● 解剖病理科     ● 影像醫學科     ● 臨床病理科         

● 社會服務室     ● 品質管理中心     ● 營養治療科     ● 藥學部     ● 護理部