泌尿外科秉持上人籌建慈濟醫院的慈悲心，以守護生命、守護健康、守護愛為宗旨；目前大林慈院泌尿科共有五位泌尿科專科醫師，其中鄭文炫醫師借調布吉納法索醫療服務團；尿路動力檢查技術員1人、體外震波碎石室技術員1人及泌尿科專科護理師1人，提供病人醫學中心級之臨床診療服務。

主要服務內容為一般泌尿方面疾病診和處置及手術、泌尿腫瘤手術、 攝護腺超音波切片及刮除手術、雷射汽化手術、尿路結石手術；未來發展：尿路結石診斷及治療中心、尿路功能障礙診斷及治療中心、癌症預防及治療中心，並結合大學及研究機構進行疾病成因之研究、分析，如何改善目前治療結果及如何預防及改善疾病之復發，朝向卓越泌尿研發中心努力。

隨著醫療診斷、治療技術的進步，人類的壽命不斷延長，而相對罹病的機會及時間亦逐漸增加；「早期診斷、早期治療」、「預防重於治療」的觀念愈趨受到重視。而如何將疾病於未造成患者嚴重傷害前做出診斷並給予適當處置，進而教育、指導病人，改善生活方式，避免致病危險因子，建立以病人為中心的健康照護典範，是本科致力追求的目標。

本科歷史:
八十九年八月大林慈院開始提供泌尿科服務。
九十年十一月起提供體外震波碎石術治療尿路結石。
九十一年十二月引進根除性攝護腺切除術。
九十三年五月引進腹腔鏡腎臟切除術治療腎臟癌及萎縮腎臟。
九十三年七月引進腹腔鏡截斷式腎盂整型術治療腎盂輸尿管狹窄引起的腎水腫。
九十五年十月引進腹腔鏡腎臟輸尿管切除術治療腎盂、輸尿管之尿路上皮癌。
九十六年十月引進攝護腺銩雷射手術治療不宜以傳統手術刮除的攝護腺肥大患者。
九十七年六月引進綠光雷射攝護腺汽化術治療不宜以傳統手術刮除的攝護腺肥大患者。
一百零七年六月引進多波光雷射攝護腺切除術。

1. 類泌尿疾病：尿路結石、膀胱炎、攝護線肥大、男性不孕症
2. 各類泌尿症狀：血尿、夜尿、排尿困難、排尿疼痛、尿失禁、頻尿、生殖泌尿道外傷、性功能障礙、包皮過長、陰囊積水、疝氣
3. 各類泌尿腫瘤：前列腺癌症、膀胱癌症、腎臟癌症於腫瘤分纇